Nous lançons un nouveau certificat de formation à votre rythme pour tous les membres de la communauté CSAFS : Personnel Hautement Qualifié, ÉRI, Génome Canada, Centres de génomique et partenaires. Développez des connaissances et des compétences pratiques grâce à un apprentissage flexible qui s'adapte à votre emploi du temps pour soutenir vos recherches sur les enjeux climatiques !
Le Centre de collaboration sur les données en agriculture durable (CCD-AD) crée et organise des occasions de formation, du matériel d’apprentissage et d’autres ressources, en mettant l’accent sur la promotion des pratiques de données FAIR tout au long du cycle de vie des données. Nous mettons l’accent sur la gouvernance et l’harmonisation des métadonnées, ainsi que sur la gestion des données de recherche et l’analyse des données.
Le CCD-AD créera et organisera des occasions de formation, y compris des ateliers et une série de webinaires réguliers portant sur divers sujets liés aux données. Ces webinaires seront accessibles en direct, mais ils seront également enregistrés et accessibles sur demande sur notre chaîne YouTube.
Surveillez cet espace pour découvrir les ateliers, les webinaires vidéo et les autres ressources d’apprentissage qui seront publiés ici dès qu’ils deviendront disponibles. Pour toute question au sujet des occasions de formation du CCD-AD, communiquez avec Luba Vasiluk: cs.dcc@climatesmartagrifood.ca
Décentraliser les données pour une recherche climato-intelligente : politiques, infrastructure et confiance (webinaire)
Enregistré le 08 avril 2026, disponible sur la chaîne YouTube de CPSC..
Étude de cas de superposition d'ontologie sur un champ de données (Séance de groupe de discussion)
Enregistré le 18 mars 2026, disponible sur YouTube.
L’opacité de l’harmonisation des données (Séance de groupe de discussion)
Enregistré le 17 mars 2026, disponible sur YouTube.
Le QQOQCCP du CCD-AD (Présentation)
Enregistré le 12 mars 2026, disponible sur YouTube.
sécurité, confidentialité et protection des données (webinaire)
Enregistré le 10 février 2026, disponible sur YouTube.
Formation et ressources GitHub (webinaire)
Enregistré le 23 septembre 2025, disponible sur YouTube.
Atelier d'analyse du microbiome ACB/CCD-AD
Cet atelier, organisé par les Ateliers Canadiens de Bio-Informatique, se tiendra du 15 au 18 septembre 2026 à l'Université de Guelph.Il est ouvert à tous, mais les membres de notre réseau CSAFS bénéficieront d'un accès prioritaire et d'un tarif réduit.
Une expérience des langages de programmation UNIX et R/Python est requise pour cet atelier. Si vous n'êtes pas familiarisé avec ces langages, une une séance préparatoire virtuelle le 26 au 28 août 2026,animée par les Carpentries, qui couvrira cette compétence.
Bourse d'études CCD-AD en traitement et analyse de données
Le CCD-AD soutient la collaboration entre le portefeuille de CSAFS et notre vaste réseau de recherche. Notre programme de bourses finance des stagiaires (baccalauréat, maîtrise, doctorat et postdoctorat) pour travailler sur des projets liés aux objectifs du portefeuille. Nous visons à promouvoir l'engagement des stagiaires en sciences des données, à contribuer à leur développement de carrière et, ultimement, à renforcer la position du Canada au sein de la communauté de recherche en traitement et analyse des données. Pour en savoir plus sur nos bourses d'études, veuillez nous envoyer un courriel à l'addresse suivante : cs.dcc@climatesmartagrifood.ca.
Programme de certification de formation CSAFS
CCD-AD et CA-AG ont lancé une formation certifiante à rythme libre pour les membres de la communauté CSAFS : Personnel Hautement Qualifié, ÉRI, Génome Canada, Centres de génomique et partenaires. Pour en savoir plus, cliquez ici.
Cette section met en lumière les ateliers, conférences et événements dans les domaines de la bioinformatique et des données. Pour des événements plus généraux liés à l'alimentation, à l'environnement et à l'agriculture, consultez notre page Événements..
Si vous souhaitez que nous ajoutions un événement à cette liste, veuillez nous envoyer un courriel à l'adresse suivante : cs.dcc@climatesmartagrifood.ca.
17 mars 2026 Groupe de travail CCD-AD : Outils et meilleures pratiques pour l’élaboration de normes de données (En ligne, ouvert aux membres du portefeuille CSAFS, y compris les ÉRI, les pôles et les centres de génomique)
18 mars 2026 Groupe de travail CCD-AD : Superposition d’ontologies sur un champ de données (En ligne, ouvert aux membres du portefeuille CSAFS, y compris les ÉRI, les pôles et les centres de génomique)
22-23 avril 2026 Atelier d'apprentissage automatique – Ateliers canadiens de bio-informatique (Edmonton, AB, Canada ET Vancouver, C-B, Canada)
12-13 mai 2026 Atelier d'analyse des voies métaboliques et des réseaux – Ateliers canadiens de bio-informatique (Calgary, AB, Canada ET Saskatoon, SK, Canada)
27 mai 2026 Recherche reproductible : les éléments essentiels pour la gestion de vos données – Ateliers canadiens de bio-informatique (Toronto, ON, Canada)
27-29 mai 2026 Canadian Bioinformatics Hub Conference (Toronto, ON, Canada)
26-27 octobre 2026 Cultivating Resilience Summit (Calgary, AB, Canada)
Cette section propose des ressources pour plusieurs ateliers et cours à la demande et réguliers dans les domaines de l'alimentation, de l'agriculture, de la bioinformatique et des données. Si vous pensez qu'une ressource manque à cette liste et que vous souhaitez que nous l'ajoutions, veuillez nous écrire à l'adresse suivante: cs.dcc@climatesmartagrifood.ca.
Tout au long de l’année, Bioinformatics.ca organise des ateliers de bioinformatique pour différents niveaux, en présentiel et en ligne, partout au Canada. Consultez leur site web pour connaître les ateliers à venir et obtenir plus d'informations.
Statistique Canada offre plusieurs cours de formation en littératie des données, y compris une formation payante dirigée par un enseignant et des cours gratuits en ligne à progression autocontrôlée.
Calcul Québec offre une vaste gamme de cours de formation en informatique, y compris sur la programmation, l’analyse et l’utilisation des superordinateurs. Visitez sa page Web des formations pour en savoir plus sur les cours de formation offerts.
La bibliothèque de l’Université de Guelph organise une série d’ateliers sur les compétences en matière de données chaque semestre, conçue pour soutenir les chercheurs de tous niveaux à chaque étape du cycle de vie des données de recherche. Des ateliers à rythme libre, asynchrone et en direct, animés par un animateur, sont offerts. Pour obtenir des ressources supplémentaires de la bibliothèque de l’Université de Guelph, communiquez avec Lucia Costanzo : lcostanz@uoguelph.ca
L’Université de Waterloo offre des cours et des programmes sur la science des données, l’analyse des données et l’intelligence artificielle.
La bibliothèque de l’Université de Toronto offre des ateliers périodiques sur la gestion des données, la science des données, l’intelligence artificielle et plus encore.
L’Université de la Colombie-Britannique organise régulièrement des ateliers sur une grande variété de sujets liés aux données, y compris le calcul informatique de pointe en recherche (CIPR), la visualisation des données, les dépôts de données, les interfaces de programmation d’applications (API), le nommage et le formatage des fichiers, et plus encore. Filtre par événements offerts à la bibliothèque de l’UBC à Vancouver, à la bibliothèque du campus de l’Okanagan, au centre de calcul informatique de pointe de l’UBC et options virtuelles.
L’Alliance de recherche numérique du Canada (ARNC) offre des ressources de formation sur la gestion des données de recherche et la navigation dans les dépôts de données. Consultez sa page Web des ressources de formation and their Explora events page (new) for more details.
La Global Research Alliance (GRA) on Agricultural Greenhouse Gases offre un programme d’apprentissage électronique comprenant trois cours en ligne de 60 à 90 minutes, conçus pour quiconque s’intéresse aux émissions de gaz à effet de serre en agriculture. Visitez sa page d’apprentissage en ligne pour en savoir plus et suivre les cours.
Physalia Courses organise plusieurs cours et ateliers sur le codage en R, Python et d’autres langages de codage, la gestion des données et les analyses pour divers types de données. Visitez son site Web pour obtenir des renseignements sur l’inscription et les dates auxquelles les cours et les ateliers sont offerts.
Le gouvernement du Canada a mis à jour son site Web sur la gestion des données de recherche. Consultez la page pour prendre connaissance des dernières mises à jour concernant la politique de gestion des données de recherche, les possibilités de financement et les questions fréquemment posées.
Université Athabasca propose un cours d’introduction à la gestion des données de recherche. Ce cours est gratuit, mais en raison de limitations techniques, il vous sera demandé de l’acheter. Pour éviter ce paiement, saisissez le code promo «researchfree».
Nous élaborons et organisons des outils et des flux de travail pour la gouvernance, l’harmonisation et la gestion des (méta)données, ainsi que les dépôts de données et d’autres ressources. Vous trouverez ci-dessous des renseignements sur la façon d’accéder à chacun de ces outils et flux de travail et de les utiliser.
Semantic Engine: Le moteur sémantique, créé par les chercheurs du CCD-AD d’ Agri-food Data Canada à l’Université de Guelph, vous aide à rédiger des métadonnées plus efficaces en créant un schéma facilement lisible par les humains et les machines. Un schéma est un type de métadonnées qui décrit la structure sous-jacente des données et peut comprendre des renseignements utiles comme les unités des données, le format des données et des descriptions plus détaillées. Il contribue également à rendre vos données conformes aux principes FAIR : Repérables, accessibles, interopérables et réutilisables.
DataHarmonizer: Le DataHarmonizer, créé par des chercheurs du CCD-AD du Centre for Infectious Disease Genomics and One Health (CIDGOH) à l’Université Simon Fraser, est un outil libre permettant d’accélérer l’harmonisation, la validation, l’agrégation et l’analyse des données contextuelles en génomique. Il s’agit d’un éditeur et d’un valideur de chiffrier normalisé basé sur le navigateur qui peut être exécuté hors ligne et localement.
Tripal: Tripal est une boîte à outils libre pour la création de bases de données génomiques, génétiques, de sélection et biologiques.
Bento: Bento est un ensemble de microservices libres et gratuits utilisés pour construire des plateformes de données, mis au point par le Centre canadien de génomique computationnelle.En adhérant aux interfaces de programmation d’applications (API) normalisées, existantes et prévues, Bento facilite les interactions entre les diverses communautés-omiques mondiales. Ses composants réutilisables et interopérables réduisent la complexité et les frais généraux liés à la construction de portails de distribution de données.
Gen3: Gen3 est une plateforme de données pour la création de référentiels communs de données et de réseaux de maillage de données. Il s’agit de services logiciels libres qui soutiennent l’émergence d’écosystèmes de données sains en permettant l’interopérabilité et la création de ressources de données infonuagiques.
Agri-food Data Canada: Agri-food Data Canada (ADC) est hébergé à l'Université de Guelph et collabore avec les acteurs de l'écosystème des données de recherche afin de créer des outils et des formations qui accroîtront la valeur de ces données. Son site Web propose des tutoriels vidéo et des ressources expliquant comment formater et organiser correctement des fichiers de données jusqu’à 5 Go sur Borealis (voir ci-dessous).
Borealis: Borealis, le dépôt Dataverse canadien, est un dépôt canadien de données de recherche bilingue, multidisciplinaire et sécurisé, soutenu par des bibliothèques universitaires et des établissements de recherche de partout au Canada. Il s’agit d’une excellente ressource pour l’ingestion institutionnelle de données et l’octroi de licences, ainsi que pour le stockage et la conservation des données (5 Go ou moins).
Dépôt fédéré de données de recherche : Le Dépôt fédéré de données de recherche (DFDR) est une plateforme de publication bilingue qui permet de partager et de préserver les données de recherche canadiennes. Il s’agit d’un dépôt polyvalent et structuré qui est conçu sur mesure pour des jeux de données volumineux (>5 Go) et son accès n’est pas limité aux établissements d’enseignement.
Alliance de recherche numérique du Canada : Tout en offrant des services aux chercheuses et aux chercheurs du pays, l’Alliance s’est fixé comme objectif de renforcer la position du Canada au rang de chef de file de l’économie du savoir sur la scène internationale. L’intégration, la prise en charge et le financement de l’infrastructure et des activités nécessaires aux fins du calcul informatique de pointe en recherche (CIPR), de la gestion des données de recherche (GDR) et des logiciels de recherche (LR) nous permettent de fournir à la communauté de recherche la plateforme dont elle a besoin pour accéder aux outils et aux services plus rapidement que jamais. L’Alliance est un organisme sans but lucratif financé par le gouvernement du Canada. Pour obtenir des ressources supplémentaires à l’ARNC, communiquez avec Catherine Di Vita : divita@alliancecan.ca
Nous élaborons et organisons des outils et des flux de travail pour le traitement, l’analyse et la visualisation des données. Vous trouverez ci-dessous des renseignements sur la façon d’accéder à chacun de ces outils et flux de travail et de les utiliser.
Surveillez cet espace pour découvrir les outils et les flux de travail, qui seront publiés à mesure qu’ils seront créés et diffusés.
Joignez-vous à notre forum de discussion et aux communautés GitHub pour participer à la conversation. Nous avons des centres dédiés à tous les aspects du cycle de vie des données, depuis la création de schémas de données jusqu’à la collecte, la gestion, l’analyse, la sécurité et le stockage à long terme.
Soyez le premier informé des nouvelles ressources, événements et outils pour vous aider à relier la recherche, la politique et la pratique.
