The Climate-Smart Data Collaboration Centre (CS-DCC) creates and curates tools, catalogues, training opportunities, learning materials, and other resources, with a focus on promoting FAIR data practices throughout the data lifecycle. We put an emphasis on (meta)data governance and harmonization, as well as research data management and data analytics.
Le Semantic Engine, created by CS-DCC researchers from Agri-food Data Canada at the University of Guelph, helps you write clear data documentation, build sharing agreements, write descriptive metadata, collect verified data, and standardize metadata collection. The Semantic Engine has three main components: schemas, agreements, and records.
Schemas help you describe your data in a way that is easily readable by both humans and machines. A schema is a type of metadata that describes the data’s underlying structure and can include useful information such as the units of the data, the data’s format, and more detailed descriptions.
The Data Request Tracker (DRT) within the Semantic Engine helps you share your data. You can describe in custom terms how you want to make your work available. The DRT is an open source project hosted on GitHub. Email adc@uoguelph.ca to try a DRT Demo
The Semantic Engine Records function is a catalogue writer that helps you catalogue your data, your project, and more in a machine-readable format. This makes it easier for others to track your work and cite what you make.
Le DataHarmonizer, créé par des chercheurs du CCD-AD du Centre for Infectious Disease Genomics and One Health (CIDGOH) à l’Université Simon Fraser, est un outil libre permettant d’accélérer l’harmonisation, la validation, l’agrégation et l’analyse des données contextuelles en génomique. Il s’agit d’un éditeur et d’un valideur de chiffrier normalisé basé sur le navigateur qui peut être exécuté hors ligne et localement.
Access DataHarmonizer on GitHub
Watch the DataHarmonizer overview on YouTube
The TermHarvester is a python script developed by CS-DCC researchers from the Centre for Infectious Disease Genomics and One Health (CIDGOH) at Simon Fraser University to synchronize agency- or research-project-managed vocabularies with known-good online resources.
Access TermHarvester on GitHub
Watch the TermHarvester intro on YouTube
The Genovalia CS-DCC Catalogue (Laval University) is a web-based platform for cataloging and exploring research data. It allows users to view structured datasets, their metadata, and their documentation to facilitate the identification, sharing, and promotion of scientific data obtained through ICT projects in the CSAFS portfolio.
Visit the Genovalia CS-DCC Data Catalogue
Watch the Genovalia CS-DCC Catalogue Demo on YouTube
DNAstack’s CS-DCC Data Explorer contains collections of projects, schemas, data, and metadata related to the Climate-Smart Agriculture and Food Systems (CSAFS) initiative, supported by Genome Canada.
Explore CS-DCC Data Collections on DNAstack
The ContextHub is a built-for-purpose data catalogue created by CS-DCC researchers at the University of Guelph, Simon Fraser University, and Université Laval. It contains data descriptions, schemas, sample collections, and projects (following RAiD – Research Activity Identifier). ContextHub is for active data and active research (e.g. raw data, early work, or not suitable in public repositories) and enables data discovery among peer research groups. It allows for context-aware searching and prioritizes FAIR data standards.
A full version of ContextHub is coming Fall 2026!
Visit the ContextHub Prototype
Watch the ContextHub intro on YouTube
The Microbiome Analysis Workshop is a three-day course jointly hosted by the Ateliers Canadiens de Bio-Informatique and the CS-DCC that will provide an introduction to marker-gene analysis, metagenomic and metatranscriptomic data analysis, followed by hands-on practical tutorials to demonstrate the use of relevant bioinformatics and statistical tools.
The workshop is open to everyone, but members of our CSAFS network will be given priority access and are eligible for a reduced rate.
Experience with UNIX and R/Python programming languages is required for this workshop. If this isn’t something you’re familiar with, recordings of a training session with The Carpentries are available to CSAFS members on request by emailing cs.dcc@climatesmartagrifood.ca.
Option 1: Sep 15-17, 2026 at the University of Guelph (Guelph, ON)
Option 2: Jan 2027 (exact date TBD) at the University of Alberta (Edmonton, AB)
The CS-DCC and AG-ACt have jointly launched a self-paced training certificate for members of the CSAFS community: HQPs, ICTs, Genome Canada, Genome Centres, and partners. Build practical knowledge and skills with flexible learning that fits your schedule and supports your climate-smart research!
The CS-DCC supports collaboration between the CSAFS portfolio and our wider research network. Our scholarship program funds trainees (undergraduates, Masters, PhD, and postdocs) to work on projects related to the portfolio’s objectives. We aim to promote engagement of trainees in data science, help develop their careers, and ultimately strengthen Canada’s position in the data processing and analytics research community.
To learn more about our scholarship opportunities, email cs.dcc@climatesmartagrifood.ca.
Agri-food Data Canada: Agri-food Data Canada (ADC) est hébergé à l'Université de Guelph et collabore avec les acteurs de l'écosystème des données de recherche afin de créer des outils et des formations qui accroîtront la valeur de ces données. Son site Web propose des tutoriels vidéo et des ressources expliquant comment formater et organiser correctement des fichiers de données jusqu’à 5 Go sur Borealis (voir ci-dessous).
Borealis: Borealis, le dépôt Dataverse canadien, est un dépôt canadien de données de recherche bilingue, multidisciplinaire et sécurisé, soutenu par des bibliothèques universitaires et des établissements de recherche de partout au Canada. Il s’agit d’une excellente ressource pour l’ingestion institutionnelle de données et l’octroi de licences, ainsi que pour le stockage et la conservation des données (5 Go ou moins).
Alliance de recherche numérique du Canada : Tout en offrant des services aux chercheuses et aux chercheurs du pays, l’Alliance s’est fixé comme objectif de renforcer la position du Canada au rang de chef de file de l’économie du savoir sur la scène internationale. L’intégration, la prise en charge et le financement de l’infrastructure et des activités nécessaires aux fins du calcul informatique de pointe en recherche (CIPR), de la gestion des données de recherche (GDR) et des logiciels de recherche (LR) nous permettent de fournir à la communauté de recherche la plateforme dont elle a besoin pour accéder aux outils et aux services plus rapidement que jamais. L’Alliance est un organisme sans but lucratif financé par le gouvernement du Canada. Pour obtenir des ressources supplémentaires à l’ARNC, communiquez avec Catherine Di Vita : divita@alliancecan.ca
Dépôt fédéré de données de recherche : Le Dépôt fédéré de données de recherche (DFDR) est une plateforme de publication bilingue qui permet de partager et de préserver les données de recherche canadiennes. Il s’agit d’un dépôt polyvalent et structuré qui est conçu sur mesure pour des jeux de données volumineux (>5 Go) et son accès n’est pas limité aux établissements d’enseignement.
Tripal: Tripal est une boîte à outils libre pour la création de bases de données génomiques, génétiques, de sélection et biologiques.
Bento: Bento est un ensemble de microservices libres et gratuits utilisés pour construire des plateformes de données, mis au point par le Centre canadien de génomique computationnelle.En adhérant aux interfaces de programmation d’applications (API) normalisées, existantes et prévues, Bento facilite les interactions entre les diverses communautés-omiques mondiales. Ses composants réutilisables et interopérables réduisent la complexité et les frais généraux liés à la construction de portails de distribution de données.
Gen3: Gen3 est une plateforme de données pour la création de référentiels communs de données et de réseaux de maillage de données. Il s’agit de services logiciels libres qui soutiennent l’émergence d’écosystèmes de données sains en permettant l’interopérabilité et la création de ressources de données infonuagiques.
The Canadian Bioinformatics Hub hosts a variety of bioinformatics workshops across Canada. Their Bioinformatics Workshops are tailored for various skill levels and have in-person, distributed, and virtual options. Visit their website for upcoming workshop opportunities, and for more information.
Statistique Canada offre plusieurs cours de formation en littératie des données, y compris une formation payante dirigée par un enseignant et des cours gratuits en ligne à progression autocontrôlée.
Calcul Québec offre une vaste gamme de cours de formation en informatique, y compris sur la programmation, l’analyse et l’utilisation des superordinateurs. Visitez sa page Web des formations pour en savoir plus sur les cours de formation offerts.
La bibliothèque de l’Université de Guelph organise une série d’ateliers sur les compétences en matière de données chaque semestre, conçue pour soutenir les chercheurs de tous niveaux à chaque étape du cycle de vie des données de recherche. Des ateliers à rythme libre, asynchrone et en direct, animés par un animateur, sont offerts. Pour obtenir des ressources supplémentaires de la bibliothèque de l’Université de Guelph, communiquez avec Lucia Costanzo : lcostanz@uoguelph.ca
L’Université de Waterloo offre des cours et des programmes sur la science des données, l’analyse des données et l’intelligence artificielle.
La bibliothèque de l’Université de Toronto offre des ateliers périodiques sur la gestion des données, la science des données, l’intelligence artificielle et plus encore.
L’Université de la Colombie-Britannique organise régulièrement des ateliers sur une grande variété de sujets liés aux données, y compris le calcul informatique de pointe en recherche (CIPR), la visualisation des données, les dépôts de données, les interfaces de programmation d’applications (API), le nommage et le formatage des fichiers, et plus encore. Filtre par événements offerts à la bibliothèque de l’UBC à Vancouver, à la bibliothèque du campus de l’Okanagan, au centre de calcul informatique de pointe de l’UBC et options virtuelles.
L’Alliance de recherche numérique du Canada (ARNC) offre des ressources de formation sur la gestion des données de recherche et la navigation dans les dépôts de données. Consultez sa page Web des ressources de formation and their Explora events page (new) for more details.
La Global Research Alliance (GRA) on Agricultural Greenhouse Gases offre un programme d’apprentissage électronique comprenant trois cours en ligne de 60 à 90 minutes, conçus pour quiconque s’intéresse aux émissions de gaz à effet de serre en agriculture. Visitez sa page d’apprentissage en ligne pour en savoir plus et suivre les cours.
Physalia Courses organise plusieurs cours et ateliers sur le codage en R, Python et d’autres langages de codage, la gestion des données et les analyses pour divers types de données. Visitez son site Web pour obtenir des renseignements sur l’inscription et les dates auxquelles les cours et les ateliers sont offerts.
Le gouvernement du Canada a mis à jour son site Web sur la gestion des données de recherche. Consultez la page pour prendre connaissance des dernières mises à jour concernant la politique de gestion des données de recherche, les possibilités de financement et les questions fréquemment posées.
Université Athabasca propose un cours d’introduction à la gestion des données de recherche. Ce cours est gratuit, mais en raison de limitations techniques, il vous sera demandé de l’acheter. Pour éviter ce paiement, saisissez le code promo «researchfree».
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