CCD-AD
Centre de collaboration sur les données en agriculture durable
À propos
Nous améliorons l’accessibilité et l’interopérabilité des données générées par les chercheurs de l’initiative Production bioalimentaire durable et adaptée au climat.
Le Centre de collaboration sur les données en agriculture durable (CCD-AD) collabore avec les neuf Équipes de Recherche Interdisciplinaire (ÉRIs) du portefeuille de recherche, servant de lien entre les projets.
Nous nous concentrons sur la gouvernance et l’harmonisation des (méta)données, ainsi que sur la gestion des données de recherche, l’analyse des données et les politiques de partage des données. Le CCD-AD vise à stimuler les innovations en omiques dans la recherche sur l’agriculture et les systèmes alimentaires durable.
Notre Vision
Améliorer la résilience face aux changements climatiques et appuyer la recherche en génomique agroalimentaire canadienne en établissant un écosystème de données pour l’échange de données de recherche et de connaissances.
Notre Mission
Élaborer et offrir une infrastructure, des outils, de la formation et des forums pour les chercheurs utilisant des données agroalimentaires, y compris un écosystème de données interopérable et distribué, de manière à leur permettre d’améliorer leurs actifs de données et d’accroître l’impact de leur recherche.
Nos principes fondamentaux
La fragmentation des efforts de recherche entraîne souvent des redondances, un ralentissement de l'adoption et un ralentissement du transfert des connaissances. Ces principes fondamentaux guident notre travail pour relever ces défis et bâtir un écosystème de données coordonné et adapté à l'avenir.
Propriété et souveraineté des données
Les chercheurs et les communautés contrôlent leurs données. Nous respectons la gouvernance, la confidentialité et les principes communautaires tels que l’ OCAP et l’inclusion des communautés autochtones.
Principes FAIR et ouverture responsable
Nous privilégions les principes FAIR et encourageons l’ouverture par un partage progressif et équitable, le cas échéant, en veillant toujours à l’équilibre entre confiance, éthique et sécurité.
Renforcement des capacités tout au long du cycle de vie des données
Des données de travail actifs aux archives publiées, nous fournissons des outils, des catalogues et des flux de travail pour faciliter la collaboration.
Automatisation et interopérabilité
Nous proposons des formats lisibles par machine, des schémas et des vocabulaires normalisés pour une intégration et une réutilisation fluide.
Nos services et activités
Catalogue de données
Nous sélectionnerons et recommanderons des catalogues de données où les ÉRIs pourront déposer et partager leurs données et métadonnées, et nous indiquerons les ensembles de données et de métadonnées génomiques qui peuvent être partagés publiquement. Nous travaillons au catalogage actif des données, en aidant les chercheurs des ÉRIs à déposer et à cataloguer leurs données d’archives. Vous trouverez plus d’information ainsi que des descriptions des différents ensembles de données qui sont recueillis par nos chercheurs des ÉRIs sur notre page GitHub.
Gestion des données de recherche
Nous développons un écosystème de gestion des données de recherche (GDR) ouvert et inclusif qui encourage les partenariats dans divers domaines et secteurs. La gestion des données de recherche désigne la façon dont le cycle de vie des données est géré, depuis leur collecte, leur documentation et leur analyse jusqu’à leur partage, leur stockage et leur préservation, même après l’achèvement du projet initial.
Traitement et analyse des données
Nous élaborons et tenons à jour des outils pour vous aider à organiser vos données et vos métadonnées, ainsi que des boîtes à outils et des flux de travail pour vous aider à analyser et à visualiser vos données.
Gouvernance des données
Nous aidons les chercheurs à s’assurer que leurs données soient stockées en toute sécurité, « repérables » et « accessibles ». La gouvernance des données implique également d’identifier les propriétaires des données et de déterminer qui peut accéder aux données et les utiliser. Nous mettons l’accent sur le partage équitable des données au profit de la collectivité.
Harmonisation des données
Nous aidons les chercheurs à partager et à développer la documentation de leurs données, ainsi qu’à unifier leurs types de données, afin que leurs données soient dans des formats compatibles et comparables (« interopérables ») entre plusieurs plateformes et domaines de recherche. L’objectif de l’harmonisation des données est d’utiliser une façon standard de décrire les données et d’être en mesure de combiner les données de différents projets de recherche afin de permettre une analyse à plus haut niveau et de fournir de nouvelles informations (réutilisables).
Renforcement des capacités communautaires et éducation
Nous créons et organisons des occasions de formation continue pour les chercheurs au Canada. Cela comprend des webinaires, des séminaires, des ateliers, des conférences et un programme de bourses d’études.
Nous proposons également de nombreuses opportunités de formation et d'apprentissage, allant de webinaires enregistrés à un programme de certification de formation à votre rythme, en passant par des bourses d'études.
Joignez-vous à nous
Faisons du Canada un chef de file mondial de l’agriculture adaptée au climat.
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Voici notre équipe
Chercheurs Principaux
A. Michelle Edwards, PhD, MLIS
Directrice, stratégie relative aux données agroalimentaires
Chercheuse principale, CCD-AD
Université de Guelph
William Hsiao, PhD
Associate Professor, Faculty of Health Science
Chercheuse principale, CCD-AD
Université Simon Fraser
Claude Robert, PhD
Professor, Faculty of Agricultural and Food Sciences
Chercheuse principale, CCD-AD
Université Laval
A. Michelle Edwards, PhD, MLIS
Directrice, stratégie relative aux données agroalimentaires Chercheuse principale, CCD-AD Université de Guelph
A. Michelle Edwards, PhD, MLIS
Directrice, stratégie relative aux données agroalimentaires Chercheuse principale, CCD-AD Université de Guelph
Michelle Edwards est directrice de la stratégie des données agroalimentaires à l’Université de Guelph (U de G) et chercheuse principale pour le CCD-AD. Avant d’occuper son poste actuel, elle a été consultante en statistique et conseillère pour le Collège d’agriculture de l’Ontario et directrice académique du centre de données de recherche, tous deux à l’U de G. Avant de retourner à l’U de G, elle a été directrice des services de données au Cornell Institute for Social and Economic Research à l’Université Cornell.
Elle apporte au CCD-AD plus de 20 ans d’expérience et de leadership en gestion des données et en stratégie. Elle est titulaire d’un doctorat en biosciences animales de l’Université de Guelph et d’une maîtrise en bibliothéconomie et en science de l’information de l’Université Western Ontario. Elle a contribué à la gestion des données et à l'expertise en matière de recherche au Collège d’agriculture de l’Ontario de l’Université de Guelph en soutenant la conception expérimentale, l’analyse statistique et la production d’articles de revues. À titre de responsable d’Agri-food Data Canada, elle et son équipe offrent un soutien en matière de gestion des données aux chercheurs dans le but de les aider à partager et à réutiliser les données de recherche.
William Hsiao, PhD
Professeur agrégé, Faculté des sciences de la santé Chercheur principal, CCD-AD Université Simon Fraser
William Hsiao, PhD
Professeur agrégé, Faculté des sciences de la santé Chercheur principal, CCD-AD Université Simon Fraser
William Hsiao est professeur agrégé à la Faculté des sciences de la santé (FHS) de l’Université Simon Fraser, chercheur principal du Center for Infectious Disease Genomics and One Health et chercheur principal pour le CCD-AD. Avant de se joindre à la FHS en 2020, il était bioinformaticien en chef et scientifique principal au BC Centre for Disease Control Public Health Laboratory (BCCDC PHL) et professeur agrégé de clinique à l’Université de la Colombie-Britannique. Il a reçu le prix Michael Smith Health Research BC Scholar Award en 2019. La recherche de William intègre la science des données et l’ingénierie des connaissances pour soutenir le partage, l’intégration et l’harmonisation des données dans une optique « Une seule santé ». Son équipe a élaboré plusieurs ontologies notables (GenEpiO.org et foodon.org) et des outils axés sur l’ontologie pour améliorer l’extraction et la réutilisation des données biologiques, conformément aux principes FAIR. Fort de son expérience dans la recherche en génomique et en science des données, tant dans le milieu universitaire que dans les laboratoires gouvernementaux (santé publique et santé animale), William se consacre à la formation de la prochaine génération de bioinformaticiens dans le domaine de la santé publique et de la recherche sur les maladies infectieuses.
Claude Robert, PhD
Professeur, Faculté des Sciences de l’Agriculture et de l’Alimentation Chercheur principal, CCD-AD Université Laval
Claude Robert, PhD
Professeur, Faculté des Sciences de l’Agriculture et de l’Alimentation Chercheur principal, CCD-AD Université Laval
Claude Robert est professeur à la Faculté des Sciences de l’Agriculture et de l’Alimentation de l’Université Laval et chercheur principal pour le CCD-AD. Il est titulaire d’un baccalauréat en biochimie de l’Université de Sherbrooke et d’une maîtrise et d’un doctorat en sciences animales de l’Université Laval. Il a également fait un stage postdoctoral à l’Université de Guelph sous la supervision d’Allan King, Ph. D.
Il s’intéresse depuis longtemps à la façon dont les techniques de procréation assistée peuvent influer sur les phases précoces du développement embryonnaire. À l’heure actuelle, ses projets de recherche portent sur l’étude de la physiologie ovarienne – c’est-à-dire la connectivité intercellulaire entre les cumulus et l’ovocyte – en utilisant des modèles bovins et murins. Il dirige des projets en génétique et en génomique sur des modèles animaux, par exemple le bœuf, le porc, le caribou/renne et les abeilles domestiques, et collabore également à des projets semblables d’autres chercheurs.
Il est directeur de Genovalia, un nouveau centre de données en génomique non humaine à l’Université Laval. Il est également codirecteur du Centre de recherche en reproduction, développement et santé intergénérationnelle, un centre de recherche axé sur la biologie reproductive ainsi que sur l’utilisation responsable et éthique des technologies de reproduction. Il est l’ancien directeur du Réseau Québécois en Reproduction, un réseau composé de plus de 100 équipes de recherche investies dans la recherche sur la biologie reproductive.
Membres de l’équipe
Damion Dooley
Responsable du développement de l’ontologie, CIDGOH Cochercheur, CCD-AD Université Simon Fraser
Damion Dooley
Responsable du développement de l’ontologie, CIDGOH Cochercheur, CCD-AD Université Simon Fraser
Damion Dooley est responsable du développement de l’ontologie au Centre for Infectious Disease and One Health (CIDGOH), un groupe réunissant plus de 20 chercheurs en bioinformatique et en ontologie à l’Université Simon Fraser. Ses travaux d’ontologie ont débuté en 2013 au BC Centre for Disease Control afin de soutenir le séquençage et l’analyse rapides du génome complet des pathogènes entériques. Il a dirigé la création de l’ontologie alimentaire FoodOn et du groupe de travail conjoint sur l’ontologie alimentaire afin de faciliter le partage des données sur les maladies d’origine alimentaire, l’agriculture, la nutrition et la science de l’alimentation. FoodOn est maintenant utilisé et soutenu par un large éventail de projets de recherche et de partage de données entre des organismes. Il a également dirigé l’élaboration de l’outil DataHarmonizer du Réseau canadien de génomique COVID-19, qui a facilité la normalisation des données canadiennes sur les échantillons biologiques de la COVID-19 et leur soumission aux dépôts nationaux et internationaux. Il participe également au comité des opérations de l’Open Biological and Biomedical Ontologies Foundry, ainsi qu’à la conservation de l’Ontology for Biomedical Investigatio (OBI). Il se réjouit à la perspective d’un avenir où les données respectent les principes FAIR et sont harmonisées de manière à réduire les obstacles à la découverte et à la compréhension dans un monde en évolution rapide. Le rôle de Damion au sein du CCD-AD consiste notamment à appuyer les efforts d’harmonisation des données, en mettant l’accent sur l’établissement de liens avec les normes de données existantes et nouvelles encadrant les métadonnées relatives au microbiome du sol, ainsi que les données relatives aux changements climatiques et à la durabilité.
Jun Duan, PhD
Responsable de l'informatique dématérialisée, CIDGOH Développeur de la gestion des données, CCD-AD Université Simon Fraser
Jun Duan, PhD
Responsable de l'informatique dématérialisée, CIDGOH Développeur de la gestion des données, CCD-AD Université Simon Fraser
Jun Duan est responsable de l’infonuagique OU l'informatique dématérialisée au Centre for Infectious Disease Genomics and One Health (CIDGOH), où il contribue à l’infrastructure informatique de haute performance et au développement de pipelines de données bioinformatiques. Il travaille à l’Université Simon Fraser (USF).
Il a achevé son doctorat à l’Université Southwest, en Chine, où il a contribué au projet de séquençage du génome du ver à soie. Son travail était axé sur l’analyse des données génomiques et la génomique fonctionnelle. Il a poursuivi ses recherches en génomique et en bioinformatique à l’Université de Chongqing. Par la suite, il a obtenu une bourse de recherche postdoctorale à l’Université de Guelph, où il a travaillé sur la génomique des ravageurs forestiers et identifié les gènes cibles aux fins de la lutte antiparasitaire grâce à des approches fondées sur l’interférence ARN. Il a ensuite travaillé comme associé de recherche à l’Université de la Colombie-Britannique et au BC Centre for Disease Control, contribuant ainsi à la recherche sur l’influenza aviaire. Il possède une vaste expertise en infonuagique, en génomique et en bioinformatique. Son rôle au sein du CCD-AD est axé sur la mise en place d’une infrastructure de gestion des données interopérable, sécurisée et évolutive afin d’appuyer la recherche collaborative et l’échange de données dans l’ensemble du réseau de recherche distribué du Canada.
Ivan Gill, MSc
Développeur de logiciels, CIDGOH Développeur de logiciels, CCD-AD Université Simon Fraser
Ivan Gill, MSc
Développeur de logiciels, CIDGOH Développeur de logiciels, CCD-AD Université Simon Fraser
Ivan develops software applications for processing public health data, including the data visualization tool VIRUS-MVP, and the aptly named data harmonization app DataHarmonizer. He holds an MSc in Bioinformatics from the University of British Columbia (UBC), and BSc degrees in Computer Science and Biology.
Emma Griffiths, PhD
Responsable de l'harmonisation des données, CIDGOH Cochercheuse, CCD-AD Université Simon Fraser
Emma Griffiths, PhD
Responsable de l'harmonisation des données, CIDGOH Cochercheuse, CCD-AD Université Simon Fraser
Emma Griffiths a obtenu son doctorat en biochimie à l'Université McMaster (Ontario), où elle a étudié la phylogénie bactérienne et les marqueurs moléculaires évolutifs. Elle possède également une expérience postdoctorale en génétique fongique et chimique, ainsi qu'en développement d'ontologies pour l'étude et la surveillance des épidémies de maladies infectieuses. Ses recherches actuelles portent sur l'application d'ontologies et de l'approche « Une seule santé » afin d'améliorer le partage des données contextuelles issues du séquençage du génome entier et de lutter contre la résistance aux antimicrobiens.
Carly Huitema, PhD
Gestionnaire, stratégie des données agroalimentaires Cochercheuse, CCD-AD Université de Guelph
Carly Huitema, PhD
Gestionnaire, stratégie des données agroalimentaires Cochercheuse, CCD-AD Université de Guelph
Carly Huitema est gestionnaire de la stratégie des données agroalimentaires à l’Université de Guelph (U de G). Elle fait partie de l’équipe qui dirige la conception stratégique, le développement et la gestion d’Agri-food Data Canada (ADC), la vision de l’Université de Guelph pour une plateforme en ligne intersectorielle d’analyse des données de recherche. Elle est également coprésidente du comité de direction et coprésidente du groupe de travail sur l’écosystème et la gouvernance à l’organisation Trust over IP de la Linux Foundation Digital Trust, où elle travaille à améliorer la confiance dans la sphère numérique sur Internet. Elle est titulaire d’un doctorat en microbiologie de l’Université de la Colombie-Britannique et a travaillé pendant six ans en Suisse dans une start-up spécialisée dans le diagnostic médical.
Carly s’intéresse notamment à la collaboration avec des chercheurs et des intervenants du secteur agroalimentaire au sein du gouvernement et de l’industrie afin d’améliorer l’accessibilité et l’utilisabilité des données de recherche. Elle met à profit son expérience de la science des données, des cadres réglementaires, de la gestion de projets, des écosystèmes et de la gouvernance pour rendre les données de recherche plus équitables. Son travail avec le CCD-AD consistera à superviser le développement de nouveaux outils et l’amélioration des outils existants afin d’aider les chercheurs à générer un contexte lisible par machine pour leurs données.
Jérôme Laroche, PhD
Coordonnateur, Genovalia Gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université Laval
Jérôme Laroche, PhD
Coordonnateur, Genovalia Gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université Laval
Jérôme Laroche est coordonnateur pour Genovalia, une plateforme axée sur le catalogage et l’analyse de données génomiques non humaines, et gestionnaire de projet de site pour le CCD-AD. Il travaille à l’Université Laval. Son mémoire de maîtrise était axé sur la génétique des populations de Rhizoctonia solani. Pour sa thèse de doctorat, il a étudié l’évolution moléculaire des gènes mitochondriaux des plantes. Il a obtenu ses diplômes d’études supérieures à l’Université Laval. Rhizoctonia solani, and in his PhD he studied the molecular evolution of plant mitochondrial genes. He received his graduate degrees from Université Laval.
Auparavant, il a supervisé les activités du programme de bioinformatique de l’Institut de biologie intégrative et des systèmes à l’Université Laval pendant 12 ans. Son travail actuel avec Genovalia porte sur la structuration de données génomiques non humaines et l’intégration de données génomiques dans des modèles d’IA. Il étudie également la génétique de maladies humaines telles que le cancer du sein et l’ostéoporose. Il apporte au CCD-AD sa solide expérience de l’analyse des données – y compris en bioinformatique, en statistique et en programmation – ainsi qu’en structure et organisation de données.
Ada Lu, MI
Responsable du catalogue et des métadonnées de la GDR, CCD-AD Université de Guelph
Ada Lu, MI
Responsable du catalogue et des métadonnées de la GDR, CCD-AD Université de Guelph
Ada Lu est responsable du catalogue et des métadonnées de la gestion des données de recherche (GDR) au CCD-AD. Elle travaille à l’Université de Guelph. Elle a obtenu sa maîtrise en sciences de l’information à l’Université de Toronto, avec une spécialisation en bibliothéconomie et sciences de l’information. Ada axe ses travaux sur la gestion des données de recherche. Elle a notamment travaillé au Scholars Portal comme stagiaire en préservation numérique pour Borealis, le dépôt canadien de données, où elle a analysé les formats de fichiers du dépôt afin de formuler des recommandations pour une préservation active et à long terme.
Au CCD-AD, le travail d’Ada consiste à étudier et à faire le lien entre les objectifs de recherche et les processus et besoins de gestion des données des ÉRI. Elle est ravie de collaborer avec cette équipe afin d’améliorer les outils et les flux de travail qui aideront les chercheurs de partout au Canada à décrire, à cataloguer et à partager l’information pendant les étapes de collecte active.
Sydney Morgan, PhD
Gestionnaire de communauté, HCB Coordonnatrice de la communication, CCD-AD Université Simon Fraser
Sydney Morgan, PhD
Gestionnaire de communauté, HCB Coordonnatrice de la communication, CCD-AD Université Simon Fraser
Sydney Morgan est coordonnatrice des communications pour le CCD-AD et gestionnaire de la communauté pour le Hub canadien de bio-informatique (HCB). Elle travaille à l’Université Simon Fraser (SFU). Elle a étudié la microbiologie et la biochimie de la vinification à faible intervention à l’Université de la Colombie-Britannique (campus d’Okanagan). Elle a effectué ses études postdoctorales à l’Université de Californie à San Diego, où elle a partagé ses recherches entre la recherche clinique et épidémiologique sur la COVID-19 et le microbiome maternel. Pendant plus de quatre ans, elle a également coordonné IMPACTT, un centre de recherche sur le microbiome financé par les IRSC et basé à l’Université de Calgary.
Durant son doctorat, Sydney a enseigné au Collège Okanagan, où elle a conçu et animé un cours pour un tout nouveau programme. Elle a également donné de nombreuses conférences invitées, participé à des entrevues publiques et à des présentations pour l’industrie, et a remporté plusieurs prix d’éloquence. Elle possède une expérience en organisation d’ateliers et de conférences nationales, et a animé avec succès un programme de mentorat. Son rôle au sein du CCD-AD est axé sur les stratégies de communication du centre de données, tant en interne qu'avec la communauté des données de recherche dans son ensemble.
Setayesh Sanavi, MEng
Conceptrice et programmeuse informatique, Agri-food Data Canada Coordonnatrice de la gouvernance des données, CCD-AD Université de Guelph
Setayesh Sanavi, MEng
Conceptrice et programmeuse informatique, Agri-food Data Canada Coordonnatrice de la gouvernance des données, CCD-AD Université de Guelph
Setayesh Sanavi est conceptrice et programmeuse informatique avec Agri-food Data Canada, et coordonnatrice de la gouvernance des données pour le CCD-AD. Elle travaille à l’Université de Guelph. Elle possède une solide expérience technique dans le développement de logiciels et la gestion des données. Elle a de l’expérience en tant qu’assistante pédagogique et développeuse de logiciels en Java Backend. Elle est titulaire d’une maîtrise en génie informatique de l’Université de Guelph et d’un baccalauréat de l’Amirkabir University of Technology (Iran). Ses réalisations les plus notables comprennent le développement d’applications bancaires mobiles, l’enseignement du langage Java à des étudiants et la collaboration avec des équipes agiles dans divers secteurs.
Grâce à son expertise dans la conception et la programmation informatique, des applications mobiles jusqu’aux systèmes de données à grande échelle utilisant la pile MERN stack, SQL, MongoDB, Docker et Kubernetes, elle est enthousiaste à l’idée de contribuer au succès des projets du CCD-AD.
Anoosha Sehar, MSc
Développeuse d'ontologies/Conservatrice de données, CIDGOH Coordonnatrice de la conservation des ontologies, CCD-AD Université Simon Fraser
Anoosha Sehar, MSc
Développeuse d'ontologies/Conservatrice de données, CIDGOH Coordonnatrice de la conservation des ontologies, CCD-AD Université Simon Fraser
Anoosha Sehar est développeuse d'ontologies et conservatrice de données, forte de plus de cinq ans d'expérience dans la conservation de données basée sur les ontologies et l'élaboration de normes de données dans le contexte de l'approche « Une seule santé ». Elle cogère l'ontologie alimentaire FoodOn et contribue à GenEpiO ainsi qu'à d'autres initiatives de conservation de données basées sur les ontologies au Centre de génomique des maladies infectieuses et de l'approche « Une seule santé » (CIDGOH). Spécialisée en bioinformatique, elle harmonise les métadonnées contextuelles, élabore des spécifications de données et applique des approches ontologiques pour favoriser l'interopérabilité des ensembles de données « Une seule santé » au sein de systèmes complexes et multi-sources. Elle a notamment contribué à des initiatives de surveillance génomique et d'harmonisation des données à grande échelle, telles que GRDI One Health AMR, GenomeTrakr de la FDA et le Réseau canadien de génomique de la COVID-19 (CanCOGeN). En tant que coordonnatrice de la conservation des ontologies au sein du CCD-AD, Anoosha soutient l'élaboration de spécifications de métadonnées sur le microbiome du sol et collabore avec le groupe de travail sur l'harmonisation des données et les ÉRI afin d'aligner les schémas de données de l'ensemble des projets du centre.
Pratima Shrivastava, PhD, PMP
Gestionnaire de projet, CIDGOH Gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université Simon Fraser
Pratima Shrivastava, PhD, PMP
Gestionnaire de projet, CIDGOH Gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université Simon Fraser
Pratima Shrivastava est gestionnaire de projet pour le Centre for Infectious Disease Genomics and One Health (CIDGOH) et gestionnaire de projet de site pour le CCD-AD. Elle travaille à l’Université Simon Fraser (USF). Elle a obtenu son doctorat en immunologie à l’Université hindoue de Bénarès, en Inde, avant de travailler comme chercheuse postdoctorale à l’Université nationale de Singapour et au réseau d’immunologie de Singapour. Elle possède une vaste expérience en immunologie et en recherche clinique, et cumule près de huit ans d’expérience en gestion de projet dans des milieux universitaires et hospitaliers. Elle a fait ses preuves en gérant avec succès des projets complexes et en veillant à garantir des résultats pertinents et obtenus en temps voulu.
Luba Vasiluk, PhD
Gestionnaire de portefeuille et gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université de Guelph
Luba Vasiluk, PhD
Gestionnaire de portefeuille et gestionnaire de projet sur place, CCD-AD Université de Guelph
Luba Vasiluk est gestionnaire de portefeuille et gestionnaire de projet de site pour le CCD-AD. Elle travaille à l’Université de Guelph. Son rôle actuel consiste à assurer la liaison entre tous les groupes et intervenants qui participent à l’initiative de production bioalimentaire durable et adaptée au climat de Génome Canada, notamment : Le CCD-AD, le centre de données de l’initiative, le Centre d’action en agriculture génomique (CA-AG), le centre de mobilisation des connaissances de l’initiative, les neuf Interdisciplinary Challenge Teams (ICTs), ainsi que des équipes de recherche partout au Canada qui trouvent des solutions pour réduire au minimum les effets de l’agriculture sur le climat.
Luba apporte plus de 20 ans d’expérience en recherche et 15 ans d’expertise en gestion de projet à l’équipe du CCD-AD. Elle est titulaire d’un doctorat en écotoxicologie de l’Université Simon Fraser et a terminé ses études postdoctorales à l’Université de Guelph. Elle se spécialise dans les sciences de l’environnement, en particulier la biodisponibilité et la bioaccessibilité des oligoéléments dans l’interface sol-plantes-humains. Elle gère la composante de l’Université de Guelph du CCD-AD, en surveillant l’administration du budget, la coordination des réunions et les communications pour le CCD-AD.
Alumni
Jaber Husiny, MSc
Conservateur des données et coordonnateur de la formation, CCD-AD
Université de Guelph
Adam Sadowski, MMath
Développeur de logiciels, CCD-AD
Université de Guelph
Erin Moorhead, BCom (Hons)
Étudiant en maîtrise en bibliothéconomie et sciences de l'information (MLIS)
Université de Guelph
Name
Title
Institution
Kenneth Bruskiewicz
Cochercheur, CCD-AD
Université Simon Fraser
Name
Title
Institution
Nos partenaires
Cochercheurs
Guillaume Bourque, PhD
Professeur, département de génétique humaine
Université McGill
Philippe Després, PhD
Professeur titulaire, département de physique, de génie physique et d’optique
Université Laval
Laurette Dubé, PhD
Professeur émérite
Université McGill
Lewis Lukens, PhD
Professeur, département d’agriculture végétale
Université de Guelph
Ghader Manafiazar, PhD
Professeur adjoint, Département des sciences animales et de l'aquaculture
Université Dalhousie
Athanasios Zovoilis, PhD
Professeur agrégé, département de biochimie et de génétique médicale
Université du Manitoba
Collaborateurs
Michelle Brazas, PhD
Directeur, Institut ontarien de recherche sur le cancer
Directeur scientifique, Bioinformatics.ca
Ateliers Canadiens de Bio-Informatique
Melanie Courtot, PhD
Professeure adjointe, Institut ontarien de recherche sur le cancer
Université de Toronto
Pablo Valdes Donoso, DVM, PhD
Professeur adjoint
Université de Montréal
Graham King, PhD
Directeur
Réseau international DivSeek
Seok-Bum Ko, PhD, PEng
Professeur, génie électrique et informatique, génie biomédical
Université de la Saskatchewan
Matthew Links, PhD
Professeur adjoint, Collège d'agriculture et de bioressources
Université de la Saskatchewan
James Macklin, PhD
Chercheur scientifique, en botanique et en informatique de la biodiversité
Agriculture et Agroalimentaire Canada | IRDG | GenARCC
Rodrigo Ortega Polo, PhD
Chef d’étude – Bioinformatique
Agriculture et Agroalimentaire Canada
Ian Stavness, PhD
Professeur, Département d’informatique
Université de la Saskatchewan
Formation, Ressources et Possibilités
Consultez notre page Formation et ressources, où nous avons organisé des occasions de formation, du matériel d’apprentissage et d’autres ressources créées par le CCD-AD, le CA-AG et d’autres groupes. Nous appuyons également les stagiaires dans le domaine de la science des données agroalimentaires au Canada en leur offrant des bourses et des possibilités de collaboration.
Actualités et événements
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